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Analyse de données

Je réalise l'analyse bioinformatique d'ensembles de données numériques tels que les données de transcriptomique (RNA-seq en « bulk » ou sur cellules uniques, bibliothèques SmartSeq et 10X Genomics Chromium), de protéomique, de métabolomique ou autres mesures quantitatives.

Exemples de services : alignement et quantification de lectures courtes, analyse et visualisation de grands ensembles de données, réduction de la dimensionnalité (p. ex., ACP, t-SNE, UMAP), sélection de caractéristiques (p. ex., expression différentielle), enrichissement, inférence de réseau, alignement et intégration de données, mise en correspondance d'identifiants, annotation et curation.

Le délivrable de chaque projet comprend les résultats de l'analyse et, si nécessaire, les figures pour les publications et le code correspondant. Le cas échéant, les ensembles de données peuvent être soumis à des bases de données publiques au nom du client.

Chaque projet est unique. Veuillez me contacter pour un devis.

Formation et supervision en analyse de données

Si vous avez le personnel mais qu'il n'est pas formé, j'offre une formation et une supervision individualisés pour vos collaborateurs. Ce service sera unique et spécialement orienté vers vos besoins et vos objectifs.